As infecções anaeróbias são causadas por bactérias anaeróbias. Bactérias anaeróbicas não crescem em meios sólidos no ar ambiente (0,04% de dióxido de carbono e 21% de oxigénio), mas bactérias facultativamente anaeróbicas podem crescer na presença ou ausência de ar. As bactérias microaerofílicas não crescem aerobicamente ou crescem fracamente, mas crescem melhor com 10% de dióxido de carbono ou anaerobicamente. As bactérias anaeróbias podem ser divididas em anaeróbios estritos que não podem crescer na presença de mais de 0,5% de oxigénio e bactérias anaeróbias moderadas que são capazes de crescer entre 2 e 8% de oxigénio.