Heterocariosi (del grec: heteros, que significa altre i karyon, que significa pinyol) és un terme utilitzat en biologia que significa tenir dos o més nuclis genèticament diferenciats dins el mateix miceli d'un fong o una altra forma de vida. Aquest és un tipus especial de sinciti (syncytium). Molts fongs (especialment els fongs AM arbusculars) mostren heterocariosi. En aquest cas la noció d'individu esdevé vaga, ja que la regla que un genoma= un individu ja no es pot aplicar. L'heterocariosi és més comuna en fongs i líquens, però també es presenta en fongs mucilaginosos.