Teenage Mutant Ninja Turtles III: The Manhattan Project es la tercera iteración en videojuego de la franquicia de Teenage Mutant Ninja Turtles para la Nintendo Entertainment System. Fue lanzado en Japón el 13 de diciembre de 1991, y en América del Norte en febrero de 1992. Como los juegos anteriores, fue producido por Konami. El juego fue lanzado en Japón como Teenage Mutant Ninja Turtles 2: The Manhattan Project (ティーンエージ・ミュータント・ニンジャ・タートルズ2 ザ・マンハッタンプロジェクト ''Teenage Mutant Ninja Turtles 2: The Manhattan Project''?) desde el primer juego de NES se dio un cambio de nombre en Japón, causando que las versiones japonesas de las secuelas tengan un número inferior.