La diversité des espèces et des gènes dans les communautés écologiques affecte le fonctionnement des communautés. Les deux principaux domaines où l'effet de la biodiversité sur le fonctionnement de l'écosystème ont été étudiés, sont la relation entre la diversité et la productivité, et la relation entre la diversité et la stabilité de la communauté. Plus des communautés biologiques sont diverses, plus elles semblent être productives (en termes de production de biomasse), et plus elles semblent être stables face à des perturbations que les communautés moins diverses.