Jonathan Donald Kramer (* 7. Dezember 1942 in Hartford/Connecticut; † 2. Juni 2004 in New York City) war ein US-amerikanischer Komponist, Musikwissenschaftler und -pädagoge. Kramer studierte bis 1965 an der Harvard University bei Pierre Boulez, Leon Kirchner und Billy Jim Layton und absolvierte dann ein Postgraduiertenstudium bei Jean-Claude Éloy, , Andrew Imbrie, Roger Sessions und an der University of California, wo er 1967 den Mastergrad und 1969 den Doktorgrad (Ph.D.) erlangte. Außerdem studierte er Musiktheorie bei David Lewin, Musikkritik bei und an der Stanford University Computermusik bei John Chowning (1967–68).