Mike Seeger, född 15 augusti 1933 i New York, död 7 augusti 2009 i Lexington i Virginia, var en amerikansk folkmusiker och folklorist. Seeger växte upp med traditionell musik via sin mor och sin far , som samarbetade med musikvetare som John och Alan Lomax. Han kom från en välkänd musikfamilj som inkluderar den betydligt mer kände halvbrodern Pete Seeger samt systern Peggy Seeger. Mike Seeger har varit betydelsefull för folk-scenen och omnämns bland annat i Bob Dylans biografi Chronicles: Volume One.